"Nem tão doentes, nem tão livres de doença": narrativas de mulheres com câncer de mama sobre a investigação da herança genética em um instituto oncológico de pesquisa / "Ni tan enfermas, ni tan libres de la enfermidad": relatos de mujeres con cáncer de mama sobre la investigación de la herencia genética en un instituto de investigación oncológica / "Not so sick, not so disease-free": narratives of women with breast cancer about the investigation of genetic inheritance in an oncological research institute

A tese versa sobre a susceptibilidade hereditária para o câncer de mama sob um olhar socioantropológico. O tema apresenta relevância em função da atual valorização da genética na área da oncologia e dos impactos que esse campo da medicina produz na vida das pessoas e famílias envolvidas. A partir de uma produção etnográfica, buscou-se compreender como a prática do aconselhamento genético interfere em diversos planos da vida de mulheres com câncer de mama hereditário, como o psicoafetivo, social e familiar, atendidas por um instituto oncológico de pesquisa, pertencente ao setor privado de saúde. Para investigação metodológica, utilizou-se um conjunto de dados empíricos: entrevistas semiestruturadas com mulheres com (suspeita de) câncer de mama hereditário, observação de consultas com o serviço de genética e documentos online relativos à hereditariedade da doença na mama. Como resultados, constatou-se de que modos às percepções biomédicas acerca da noção de risco atravessaram a produção de subjetividades, identidades e coletividades das interlocutoras. Outros pontos explorados nas narrativas foram: as repercussões, individuais e coletivas, ocasionadas pela experiência do aconselhamento genético e o entrelaçamento da doença e da hereditariedade a outras vivências de cunho individual. O estudo visou contribuir a dar visibilidade às experiências e as demandas das mulheres investigadas e somar aos estudos risco, biotecnologias e subjetividades.AU

This thesis is about hereditary susceptibility to breast cancer from a socio-anthropological perspective. The theme is relevant due to the current appreciation of the genetics field in the oncological area and the impact on the lives of people and families involved. From an ethnographical starting point, how genetic counselling interferes with the life planning of women with hereditary breast cancer breast in areas such as psycho-affective, social and familiar. The search was conducted in an oncological research institute that belongs to the private healthcare system. For the methodological research, it was used a set of empirical data: semi-structured interviews with (suspected) hereditary breast cancer; participant observation of genetic consultations and online documents related to the heredity of the disease in the breast. As result, it has been noticed how the biomedical perceptions about the notion of risk cross through to the interlocutors' subjective productions, identities and sense of collective. Another aspect of the narratives is the relationship of genetics with oncological illness. It also stands out the individual and collective repercussions caused by the experience of genetic counselling and the intertwining of the disease and heredity with other individual experiences. The study aimed to contribute to giving visibility to the experiences and demands of the women investigated and also to add studies of the risk, biotechnologies and subjectivities.AU

La tesis aborda la susceptibilidad hereditaria al cáncer de mama desde una perspectiva socio-antropológica. El tema es relevante debido a la actual valorización de la genética en el área de la oncología y a los impactos que ese campo de la medicina tiene en la vida de las personas y familias. Con base en una producción etnográfica, buscamos comprender cómo la práctica del asesoramiento genético interfiere en diferentes áreas de la vida de mujeres con cáncer de mama hereditario, como el psicoafectivo, social y familiar, asistidas por un instituto de investigación oncológica, perteneciente al sector privado del cuidado de la salud. La investigación se fundamenta en un conjunto de datos empíricos: entrevistas semiestructuradas con mujeres con (sospecha de) cáncer de mama hereditario, observación de consultas en el servicio de genética y documentos en línea relacionados con la herencia familiar de la enfermedad. Como resultado, se constató como las percepciones sobre la biomedicina sobre la noción de riesgo atraviesan la producción de subjetividades, identidades y colectividades de las interlocutoras. Otros puntos explorados en las narrativas fueron: las repercusiones individuales y colectivas provocadas por la experiencia de la consejería genética y el entrelazamiento de la enfermedad y la herencia con otras experiencias de carácter individual. El estudio pretendió dar visibilidad a las experiencias y demandas de las mujeres investigadas y contribuir a los estudios sobre riesgo, biotecnologías y subjetividades. AU

Estimation of genetic parameters and relationships between type traits and milk yield of Holstein cows in Turkey / [Estimativa de parâmetros genéticos e relações entre características de tipo e produção de leite das vacas Holstein na Turquia]

In this study, milk yield, reproductive yield, and type traits of 533 Holstein cows in the first lactation raised in 54 farms were examined. In the three-year study, phenotypic (rP) and genetic (rG) correlations between type traits and milk yield were estimated based on the variance elements and heritability of the type traits of Holstein cows in the first lactation. Linear identification and scoring systems have been applied to classify the cows according to type traits. Heritability and correlations were estimated with ASREML models. The type traits included stature, angularity, rump width, hocks, rear udder height, central ligament, teat length, body capacity, feet and legs, udder composite and final score for genetic correlations with 305-day milk yield were estimated as -0.49, -0.14, -0.93, 0.35, 0.40, 0.11, -0.65, 0.70, 0.31, 0.54, and 0.70, for phenotypic correlations were estimated as 0.28, 0.28, 0.30, 0.21, 0.35, 0.39, -0.06, 0.46, 0.48, 0.56, and 0.58 respectively. Among the phenotypic correlations between the type traits, especially the phenotypic correlations between the final score and various type traits were found to be high and significant. The fact that these traits are in high correlation with other traits and milk yield may enable these to be used as indirect selection criteria in the selection for milk yield.(AU)

Neste estudo, foram examinadas a produção de leite, a produção reprodutiva e as características de tipo de 533 vacas Holstein na primeira lactação criadas em 54 fazendas. No estudo trienal, as correlações fenotípicas (rP) e genéticas (rG) entre características de tipo e produção de leite foram estimadas com base nos elementos de variação e hereditariedade das características de tipo das vacas Holstein na primeira lactação. Sistemas de identificação linear e de pontuação foram aplicados para classificar as vacas de acordo com os traços de tipo. A hereditariedade e correlações foram estimadas com os modelos ASREML. Os traços de tipo incluíam estatura, angularidade, largura da alcatra, jarretes, altura do úbere traseiro, ligamento central, comprimento das tetas, capacidade corporal, pés e patas, composição do úbere e pontuação final para correlações genéticas com a produção de leite de 305 dias foram estimados como -0. 49, -0,14, -0,93, 0,35, 0,40, 0,11, -0,65, 0,70, 0,31, 0,54, e 0,70, para correlações fenotípicas foram estimadas como 0,28, 0,28, 0,30, 0,21, 0,35, 0,39, -0,06, 0,46, 0,48, 0,56, e 0,58 respectivamente. Dentre as correlações fenotípicas entre os traços de tipo, especialmente as correlações fenotípicas entre a pontuação final e vários traços de tipo foram encontradas como altas e significativas. O fato destes traços estarem em alta correlação com outros traços e a produção de leite pode permitir que sejam usados como critérios de seleção indiretos na seleção para a produção de leite.(AU)

Caracterização fenotípica de vacas F1 Holandês x Zebu de diferentes bases maternas / [Phenotypic characterization of Holsteins x Zebu F1 cows from different maternal bases]

Caracterizaram-se fêmeas F1 Holandês x Zebu de diferentes bases maternas quanto às pelagens, despigmentações e características morfométricas. Foram utilizadas 266 fêmeas F1, progênies do cruzamento de 26 touros da raça Holandesa com fêmeas de composição genética zebuínas: Gir, Nelore, Guzonel, Nelogir. Foram aplicadas análise de distribuição de frequência para características qualitativas e medidas de dispersão e tendência central para características morfométricas, e as médias foram comparadas pelo teste de Tukey a 5% de probabilidade. Acima de 60,0% dos animais foram de pelagem preta. As vacas que tiveram origem na raça Gir apresentaram comprimento de cabeça 2,8cm maior (P<0,05) que as fêmeas da raça Nelore. O comprimento da orelha variou (P<0,05) conforme a base materna utilizada. As vacas com genes da raça Nelore são 5,0cm mais altas (P<0,05). O perímetro torácico foi a característica morfométrica que teve correlação fenotípica de elevada magnitude com o peso, acima de 0,70, para as fêmeas das bases maternas Gir, Nelore e Nelogir. A pelagem não é indicativa da base materna utilizada. As vacas F1 de base materna Gir tiveram estrutura corporal menor que as fêmeas que portam genes da raça Nelore.(AU)

F1 Holstein x Zebu females from different maternal bases were characterized regarding coat, depigmentation and morphometric characteristics. A total of 266 F1 female progenies from the crossbreeding of 26 Holstein bulls with females of Zebu genetic composition were used: Gir, Nellore, Guzonel, Nellogir. Frequency distribution analysis was applied for qualitative characteristics and dispersion measures and central tendency for morphometric characteristics, and means were compared by Tukey test at 5% probability. Over 60.0% of the animals had a black coat. The cows that originated from the Gir breed had a head length of 2.8cm (P<0.05) higher than the Nellore females. Ear length varied (P<0.05) according to the maternal base used. Cows with Nelore genes were 5.0cm taller (P<0.05). The thoracic perimeter was the morphometric characteristic that had a high magnitude phenotypic correlation with weight, above 0.70, for the females of the Gir, Nellore and Nellogir maternal bases. The coat is not indicative of the maternal base used. F1 Gir-based cows had a smaller body structure than females with Nellore genes.(AU)

Inheritance study of yield components and essential oil constituents in linool type basil / Estudo da herança do rendimento e constituintes químicos do óleo essencial de manjericão tipo linalol

The aim of this study was to conduct an inheritance study for the agronomic and chemical characteristics of basil (Ocimum basilicum L.) hybrid 'Genovese' x 'Maria Bonita'. F1 seeds were obtained from a cross of P1 (Genovese) x P2 (Maria Bonita). F2 seeds were obtained from selfing five F1 plants. In this experiment, a randomized block design with three replications was used. Each replication consisted of four treatments (generations). Seven plants from each P1, P2 and F1 generation and 21 plants from the F2 generation were grown for each replication. The following characteristics were evaluated at full bloom: plant height, leaf dry weight, essential oil content and yield in the leaves and the main essential oil chemical constituent concentrations in each plant. The characteristics plant height, essential oil yield and linalool content are controlled by more than one major gene, and these genes present additive and dominant effects. High heritability was observed for the characteristics plant height, leaf dry weight and content of linalool and 1,8-cineole. The hybrid 'Genovese' x 'Maria Bonita' presented a plant height and dry leaf weight heterosis of 32.31% and 131.54%, respectively.

O objetivo deste estudo foi realizar um estudo de herança para as características agronômicas e químicas de manjericão (Ocimum basilicum L.) híbrido 'Genovese' x 'Maria Bonita'. Sementes F1 foram obtidos a partir de um cruzamento de P1 (Genovese) x P2 (Maria Bonita). Sementes F2 foram obtidas a partir de autopolinização cinco plantas F1. Neste experimento, foi utilizado um delineamento em blocos casualizados com três repetições. Cada repetição foi constituída por quatro tratamentos (gerações). Sete plantas de cada P1, P2 e geração F1 e 21 plantas da F2 foram cultivadas para cada repetição. As seguintes características foram avaliadas em plena floração: altura da planta, folha seca, teor de óleo essencial e de rendimento nas folhas e as principais concentrações essenciais constituintes químicos do óleo em cada planta. A altura características da planta, o teor de óleo essencial e rendimento de linalol são controlados por mais do que um gene principal, e estes genes presentes efeitos aditivos e dominantes. Foi observada alta herdabilidade para as características altura da planta, folha de peso seco e conteúdo de linalol e 1,8-cineol. O híbrido 'Genovese' x 'Maria Bonita' apresentou altura de planta e peso da heterose seca de 32,31% e 131,54%, respectivamente.

La epigenética: ¿el regreso de Lamarck? / Epigenetics: the return of Lamarck?

Desde hace algunos años, numerosas publicaciones sugieren un regreso de Lamarck gracias a los hallazgos de la epigenética, puesto que este campo de investigación parece desempolvar la idea de la herencia de caracteres adquiridos. Un vistazo a la historia de las ciencias de la vida, a escritos del siglo XIX de Lamarck y al Origen de las Especies de Darwin revela que esta nueva popularidad de Lamarck se basa en varias creencias equivocadas: (1) que Lamarck fue el primero en proponer la idea de la herencia de caracteres adquiridos; (2) que esa idea era el punto más singular de su teorización sobre la evolución de los seres vivos; (3) que Darwin no compartía esa creencia. En realidad, parte de la confusión se ha generado por el calificativo de "neodarwiniana" que suele asignársele a la llamada síntesis moderna, la cual combina aportes de Darwin, de Mendel y de Weismann, siendo este último un gran opositor a la idea de la herencia de caracteres adquiridos. Respecto a los hallazgos de la epigenética, dentro de la cual hay espacio tanto para la transmisión de caracteres adquiridos como para el concepto de selección natural, tal vez sería más certero hablar del regreso de los neolamarckianos franceses, o incluso de cierto naturalista muy conocido, cuya creencia en la herencia de caracteres adquiridos es mucho menos conocida: el mismo Darwin.

For some years, many publications are suggesting a return of Lamarck due to the findings of epigenetics, because this research field seems to dust off the idea of the inheritance of acquired characters. A closer look to the history of life sciences, to some nineteenth-century Lamarck's writings and to The Origin of Species by Darwin reveals that this new popularity of Lamarck is based on several misconceptions: (1) that Lamarck was the first to propose the idea of the inheritance of acquired characters; (2) that this idea was the most singular point in his theorizing about the evolution of living beings; (3) that Darwin did not share this belief. Actually, part of the confusion is due to the label "neo-Darwinian" often applied to the so-called modern synthesis, given that this one combines ideas coming from Darwin, Mendel and Weismann, and the latter was a strong opponent of the idea of the inheritance of acquired characteristics. As far as epigenetic findings are concerned, within which there is room both for the inheritance of acquired characters and for the concept of natural selection, it would possibly be more accurate to talk about the return of French neo-Lamarckians, or of a certain famous naturalist whose belief in the inheritance of acquired characters is far less famous: Darwin himself.

Síndrome de Meckel Gruber: caso clinico de recurrencia familiar / Meckel Gruber syndrome: clinical case of family recurrence

Meckel Gruber es un síndrome letal poco común, descrito por primera vez en 1822 por Meckel; se caracteriza por múltiples malformaciones congénitas que afectan principalmente la cabeza, riñones, dedos de manos y pies. De herencia autosómica recesiva, es reportado comúnmente en matrimonios consanguíneos, también ocurre en las parejas no consanguíneas. Ha sido descrito en todo el mundo, y su incidencia oscila entre 1 por 13 250 - 140 000 nacidos vivos. Comúnmente se diagnostica desde la semana 18 mediante ecografía, aunque se puede hacerlo más tempranamente en familias de alto riesgo. Se reporta el caso clínico de una paciente atendida en el Hospital Obrero No 2 de la Caja Nacional de Salud, sin antecedente de consanguinidad con su pareja, tuvo tres embarazos, de los cuales dos tenían el síndrome de Meckel-Gruber.

Meckel-Gruber is an uncommon lethal syndrome, it was described by Meckel in 1822 characterized by multiple congenital malformations, that mainly affects the head, kidneys and fingers; is a autosomal recessive inheritance, reported in consanguineous marriages, but also in non-consanguineous marriages. The worldwide incidence varies from in 13 250 to 140 000 live births. It is usually diagnosed from 18 weeks of pregnancy by ultrasound, although it can be done earlier in high-risk families. We reported the clinical case of a patient treated in Hospital Obrero No 2 de la Caja Nacional de Salud without a history of consanguinity with her partner with whom she had three pregnancies, of wich two had Meckel-Gruber syndrome.

A importância da qualidade da informação na predição de valores genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Nelore / The importance of quality information to predict breeding values for growth traits in Nelore cattle

Objetivou-se avaliar a influência da qualidade da informação na predição de valores genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram utilizadas informações de fazendas participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores, considerando-se dados zootécnicos obtidos entre 2012 e 2013. Foram analisadas as características de crescimento relacionadas aos pesos aos 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, sob diferentes cenários: inclusão de todas as informações de lote de manejo (cenário de referência) e inclusão aleatória de 90%, 70%, 50%, 30% e 0% das informações de lote de manejo dos animais com medidas fenotípicas. Os valores genéticos foram preditos mediante análises unicaracterísticas sob modelo animal. Ocorreram alterações em todos os parâmetros genéticos quando comparados aos obtidos pelo cenário de referência. Houve um aumento nas estimativas de herdabilidade à medida que se reduziu o número de informações sobre os lotes de manejo. Esses resultados sugerem que o progresso genético estimado para rebanhos com baixa qualidade da informação zootécnica pode não expressar adequadamente o que realmente está ocorrendo com o rebanho, uma vez que as estimativas de herdabilidade podem estar infladas. Verificou-se que houve alteração na classificação dos animais para todas as características de crescimento avaliadas. A qualidade da informação zootécnica influencia na predição dos valores genéticos para as características de crescimento.

The objective was to evaluate the influence of information quality in the prediction of genetic values for the Nellore cattle's growth traits. The information came from cattle farms participating in the program of the Brazilian National Association of Breeders and Researchers (ANCP), from 2012 to 2013. Field data such as batch or management group were considered assessment criteria, and the growth traits related to body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days under different scenarios: inclusion of all management lot information; and random inclusion of 90%, 70%, 50%, 30% and 0% of the batch management of information from animals with phenotypic measurements. Breeding values were predicted by using univariate models in animal model. Changes on all genetic parameters were compared to those obtained in the reference scenario. There was an increase in the estimates of heritability as it reduced the number of details about lots of management. These results suggest that gene progress estimated herds with low quality information do not adequately represent what truly occurs with the herd, since heritability estimates may be inflated. Change in the classification of animals was found at all the growth traits. The quality information influences the prediction of breeding values for growth traits.

Parâmetros e ganhos genéticos em características de crescimento de bovinos Tabapuã da Bahia / Parameters and gains in genetic characteristics of Bahia Tabapuã bovine Growth

Compararam-se dois modelos (com ou sem o efeito materno) na estimativa de parâmetros genéticos por meio do fator de Bayes (FB) e do critério de informação da deviance (DIC). Adicionalmente, avaliaram-se as tendências genéticas, maternas e fenotípicas em características de crescimento de bovinos da raça Tabapuã do estado da Bahia. O modelo que incluiu o efeito materno proporcionou menores valores de FB (167629,2; 117341,2 e 124804,8) e DIC (174550,0; 120242,7 e 128037,2) para pesos aos 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade, respectivamente. As estimativas médias, a posteriori, das herdabilidades diretas e maternas foram 0,33; 0,43 e 0,44 e 0,15; 0,14 e 0,16 para as três características, respectivamente. As tendências genéticas para o efeito direto foram de 0,4415 e 0,3613kg/ano para P205 e P365 e representam incrementos de apenas 0,25 e 0,15% nas médias das características ao ano. As tendências genéticas maternas para as três características demonstraram perdas e indicam ausência de seleção de matrizes para boa habilidade materna. Apesar de existir variabilidade genética suficiente para justificar ganhos genéticos via seleção, estes e os ganhos fenotípicos foram pequenos, sugerindo necessidade de melhorias genéticas e ambientais.(AU)

We compared two models (with or without maternal effect) in the estimation of genetic parameters through Bayes Factor (BF) and the Deviance Information Criterion (DIC). Additionally, we evaluated the genetic, maternal and phenotypic trends in Tabapuã bovine growth characteristics in the state of Bahia. The model that included the maternal effect provided smaller BF values (167,629.2; 117,341.2 and 124,804.8) and DIC (174,550.0; 120,242.7 and 128,037.2) for weights at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age, respectively. The average estimates, a posteriori, the direct and maternal heritability (0.33, 0.43 and 0.44) and (0.15, 0.14 and 0.16) for the three characteristics, respectively. Genetic trends for direct effect were 0.4415 and 0.3613kg/year for W205 and W365 and presented increases of 0.25 and 0.15% in the average characteristics of the year. The phenotypic trend for W205 was 0.7039kg/year. Maternal genetic trends for the three characteristics showed losses and indicate absence of selection matrices for good maternal ability. Despite the magnitude of the estimated direct and maternal heritability, they indicate genetic gain opportunities, genetic and phenotypic trends indicated few direct gains and no gains for maternal ability.(AU)

Modelos de regressão aleatória para características de crescimento de bovinos da raça Nelore do estado de Mato Grosso / Random regression models to traits of growth in the Nellore breed in Mato Grosso state

Foram utilizados 138.976 registros de informações de pesos corporais variando de 60 a 610 dias de idade, provenientes de 27.327 animais da raça Nelore, oriundos de rebanhos do estado do Mato Grosso, com o objetivo de descrever a variabilidade genética e estimar parâmetros genéticos para o peso corporal em diferentes idades, utilizando-se modelos de regressão aleatória. O modelo empregado incluiu efeitos fixos de grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto como covariáveis, além de efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético materno, ambiente permanente de animal, ambiente permanente materno e efeito de ambiente temporário. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi o que empregou função de covariância com polinômios de quarta ordem para descrição da variabilidade de todos os efeitos e duas classes de variância residual. As estimativas de variância genética aditiva direta e de ambiente permanente de animal aumentaram com a idade dos animais. As variâncias genética materna e de ambiente permanente materno exibiram comportamento semelhante, com maiores valores na fase de aleitamento. Os coeficientes de herdabilidade estimados variam de 0,25 a 0,43, com maiores valores nas idades mais avançadas na trajetória de crescimento dos animais. Esses resultados indicaram presença de variabilidade genética suficiente para obtenção de ganho genético expressivo por meio da seleção, principalmente após desmama. Os resultados encontrados para a correlação genética aditiva direta exibiram baixas correlações entre pesos nas idades iniciais e finais, porém pesos altamente correlacionados entre idades mais próximas. As correlações genéticas estimadas entre os pesos da desmama com os pesos até 610 dias de idade foram altas e positivas e indicam que os genes responsáveis por maiores pesos nesse período, em sua maioria, são os mesmos.

In this study 138,976 records of live weight between 60 to 610 days of age, from 27,327 Nellore cattle breed, from herds in Mato Grosso State were used in order to describe the genetic variability and to estimate genetic parameters for the live weight at different ages, using random regression models. The model included the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving as covariate, random effects of direct additive genetic, maternal genetic, animal and maternal permanent environmental and temporary environment effect. The most appropriate random regression model employed the covariance function with fourth order polynomials to describe the variability of all effects and two residual variance classes. Estimates of direct additive genetic variance and animal permanent environment increased with the age of the animals. Maternal genetic variances and maternal permanent environment exhibited similar behavior, with higher values in pre weaning. The estimated heritability coefficients ranged from 0.25 to 0.43, with higher values at older ages in the growth trajectory of the animals. These results showed the presence of sufficient genetic variability to obtain significant genetic gain through selection, especially after weaning. The results for the direct additive genetic correlation exhibited low correlations between weights in initial and final ages, however, highly correlated weights between nearest ages. Genetic correlation estimates between weaning with weights up to 610 days of age were high and positive and indicate that most of the genes responsible for higher weights in this period are the same.

Investigação de fatores genéticos na etiologia da síndrome do melanoma familial: copy number variations (CNV) e sequenciamento de exoma / Investigation of genetic factors on the familial melanoma syndrome etiology: copy number variations (CNV) and exome sequencing

O melanoma é um tipo raro e agressivo de câncer de pele e a maioria dos casos é esporádica. Entretanto, alguns indivíduos da população apresentam alta predisposição ao desenvolvimento de tipos específicos de câncer em decorrência da presença de mutações germinativas e/ou variantes genômicas de risco. Aproximadamente 10% dos casos de melanoma cutâneo são causados por mutações germinativas, em especial no locus CDKN2A, responsável por até 40% do melanoma familial. Outros genes com mutações germinativas altamente penetrantes já foram descritos no melanoma, como CDK4, POT1, TERT, entre outros, mas tais mutações são detectadas em pouquíssimas famílias. Portanto, a etiologia genética da maior parte da predisposição ao melanoma cutâneo permanece não determinada. O objetivo central deste trabalho foi a identificação de variantes genômicas raras associadas à suscetibilidade ao melanoma cutâneo em pacientes negativos para mutações nos principais genes conhecidos. Dois tipos de abordagens metodológicas foram empregadas: o estudo de variações do número de cópias de segmentos genômicos (Copy Number Variation - CNV) e sequenciamento de exoma. A análise de CNV foi realizada em uma casuística constituída por um grupo de 41 pacientes de melanoma cutâneo não relacionados (selecionados como melanoma familial e/ou melanomas múltiplos), sem mutações nos genes de predisposição a melanoma CDKN2A, CDK4, MITF e TERT. Identificamos 10 CNVs raras não recorrentes, distribuídas em 9 dos pacientes (22% da coorte). Todas as CNVs foram validadas pela técnica de PCR quantitativo em tempo real (qPCR) e, adicionalmente, não foram detectadas em um grupo controle de 400 indivíduos. As CNVs detectadas afetam segmentos genômicos grandes (>200 Kb), compreendendo 3 deleções (2q33.3-q34, 6p24.3 e 10q22.3) e 7 duplicações (6p22.1, 10q22.3, 12p12.3, 20p12.1, 4q26-q27, 8q23.1 e 9p24.2). Dentre os genes afetados pela mudança no número de cópias, os principais genes candidatos à predisposição ao melanoma cutâneo são IDH1, ANXA11 e ANGPT1. Na segunda parte deste trabalho, um subgrupo de cinco famílias de melanoma familial, sendo 2 membros afetados de cada família e negativos para CNVs raras foram selecionados para o sequenciamento de exoma. Selecionamos apenas variantes genômicas não-sinônimas que fossem raras na população geral (frequência < 0,01%) segundo bancos de dados populacionais e que estivessem presentes nos dois afetados da família; dessa forma, foram identificadas um total de 214 variantes genômicas raras não-sinônimas em 210 genes. Dentre essas, 63 foram consideradas danosas à função proteica, segundo algoritmos de predição. Oito variantes ocasionam perda de função protéica (LoF ­ loss-of-function). Entre os 210 genes afetados, os genes MYO7A e WRN, já foram previamente associados à predisposição ao melanoma cutâneo. Adicionalmente, o grupo de genes identificados no exoma está associado a diferentes fenótipos como melanoma (ITGA3, RECK, ADAMTS4, TYMP e MCM3), pigmentação e pele (COL4A2, HPS5, MLPH, VNN2, NID2, SLIT2 e HMCN1), além de suscetibilidade a câncer em geral (ZFHX3 e CTBP2). Em conclusão, nossos dados revelaram alterações germinativas raras em pacientes de melanoma famílial e/ou melanomas múltiplos, como CNVs e mutações potencialmente patogênicas. Este estudo, portanto, identificou novos fatores genéticos de suscetibilidade ao melanoma cutâneo na população brasileira, contribuindo com vários genes candidatos a serem explorados em futuros trabalhos.

Melanoma is a rare and aggressive kind of skin cancer and sporadic on the most cases. However, some people of the population shows high predisposition to development of specific types of cancer due germline mutations and/or genomic variants of risk. Approximately 10% of all cases of melanoma are caused by germline mutations, specially affecting the CDKN2A locus, which responds up to 40% of familial melanoma cases. Other genes harboring penetrant mutations were already described in hereditary melanoma such as CDK4, POT1, TERT, among others, but these mutations are identified in few families. Therefore, the most part of genetic etiology to cutaneous melanoma predisposition remains not elucidated. The main objective of this work was to identify rare genomic variants associated to the cutaneous melanoma susceptibility in melanoma-prone patients negative for mutations at the main genes associated to this syndrome. Two kinds of methodological approaches were applied: the assess to genomic segments of copy number variations (CNV) through high resolution SNP-arrays and exome sequencing. The cohort of hereditary melanoma was composed by 41 not-related cutaneous melanoma patients, without mutations affecting genes of melanoma predisposition CDKN2A, CDK4, MITF and TERT. We identified 10 not recurrent rare CNVs in 9 patients (22% of our cohort). All CNVs were validated using the quantitative real-time PCR (qPCR) and were not detected in a control group of 400 individuals. These CNVs affected large genomic segments (>200 Kb), comprising 3 deletions (2q33.3-q34, 6p24.3 e 10q22.3) and 7 duplications (6p22.1 10q22.3 12p12.3 20p12.1, 4q26-q27, 8q23.1 e 9p24.2). From this analysis the main candidate genes were: IDH1, ANXA11 e ANGPT1. The exome sequencing was performed in a subset of 5 melanoma-prone families; 2 members affected by melanoma from each family without rare CNVs. We selected non-synonimous genomic variants following 2 main criteria: rarity on population (frequency <0.1%) and common variants between patient and their affected relative. We identified a total of 214 nonsynonimous rare genomic variants in all families affecting 210 genes, which 63 were considered damaging to protein function according to prediction algorithms and 8 leads to loss-of-function (LoF). Between the 210 affected genes, were highlighted variants affecting the MYO7A and WRN genes which were previously associated to melanoma predispodition. Additionally, the set of genes identified by exome sequencing also showed relevance once are associated to melanoma phenotypes (ITGA3, RECK, ADAMTS4, TYMP and MCM3), skin and pigmentation (COL4A2, HPS5, MLPH, VNN2, NID2, SLIT2 and HMCN1) and cancer susceptibility (ZFHX3 and CTBP2). In conclusion, our data revealed rare germline alterations in familial and/or multiple melanomas, such as CNV and potential pathogenic mutations. Therefore, this study identified new genetic factors of susceptibility to cutaneous melanoma on the Brazilian population, contributing with a set of candidate genes to be deeply explored in further studies.

Parâmetros genéticos para características de prolificidade nas raças Landrace e Large White / Genetic parameters for prolificacy in Landrace and Large White breeds

Dados de suínos das raças Landrace (LD) e Large White (LW) foram utilizados para estimar componentes de variância para número total de leitões nascidos (NTN), nascidos vivos (NV) e de leitões vivos ao quinto dia (LV5). Usou-se o método da máxima verossimilhança restrita (REML) para estimar componentes de variância. O modelo misto incluiu os efeitos fixos de mês e ano de nascimento e da inseminação da porca e ordem de parto. Análises unicaracterísticas incluíram os efeitos genético direto, genético materno e de ambiente permanente. Análises multicaracterísticas foram feitas para estimar correlações genéticas. Os modelos unicaracterísticas foram comparados e o que continha apenas o efeito genético direto foi considerado o mais adequado. As estimativas de herdabilidade para NTN foram de 0,15 para LW e de 0,08 a 0,12 para LD, dependendo do modelo, para NV foram de 0,14 para LW e de 0,05 a 0,12 para LD, e para LV5, variaram de 0,11 a 0,12 para LW e de 0,03 a 0,08 para LD. As correlações fenotípicas e genéticas entre as três características foram altas e favoráveis. Conclui-se que a seleção para aumento do LV5 pode ser uma via interessante para o aumento do tamanho da leitegada, da sobrevivência de leitões e da habilidade materna em suínos.

Data from Landrace (LD) and Large White (LW) sows were analyzed to estimate variance components for total number of piglets born (NTN), number of piglets born alive (NV) and number alive on day 5 after birth (LV5). REML mixed model equations included the fixed effects of sow´s month and year of birth and insemination and farrowing order. Univariate analyses included, alternatively, direct genetic, maternal genetic and permanent environmental effects. Multiple trait analysis was performed to estimate genetic correlations among the traits. Comparisons between univariate models indicated that the model containing only direct genetic effect was the most appropriate for parameter estimation. Estimates of heritability for NTN were 0.15 in LW and ranged from 0.08 to .12 in LD, 0.14 in LW, from 0.05 to 0.12 in LD for NV, from 0.11 to 0.12 in LW, and from 0.03 to 0.08 in LD for LV5. Phenotypic and genetic correlations among traits were high and favorable. Results suggest that selection for LV5 is an interesting alternative way to increase litter size, piglet survival and maternal ability in swine.

Parâmetros genéticos para características produtivas e biométricas em abelha Melipona quadrifasciata anthidioides LEPELETIER / Genetic parameters for production and biometrics traits in honey bee Melipona quadrifasciata anthidioides LEPELETIER

Os objetivos deste trabalho foram estimar componentes de variância genética aditiva, fenotípica e residual e a herdabilidade para características relacionadas com a produção de mel e com a estrutura do ninho de abelhas Melipona quadrifasciata anthidioides. Sessenta colônias de diferentes regiões da Bahia foram transladadas para caixas padronizadas modelo INPA e divididas, originando as gerações parentais G1 e G2. Foram medidas as características: estimativa da produção de mel; número, largura, volume e altura dos potes de mel; número, altura e diâmetro dos potes de pólen; peso; número, largura e diâmetro dos discos de cria e estimativa da população da colônia. As medidas foram corrigidas para o efeito fixo de mês de mensuração. Os componentes de variância e herdabilidade foram estimados por meio do método de semelhança entre parentes, utilizando-se abordagem Bayesiana. As médias e os desvios padrão variaram de 2,01±0,70cm para diâmetro de potes de pólen a 2.333,0±384,1kg para o peso das caixas. Houve indicação de convergência para todas as cadeias obtidas. As estimativas de variância genética aditiva variaram de 0,02cm para as características largura dos potes de mel a 38.587,72kg para o peso. Para as estimativas de variâncias fenotípicas, os valores variaram de 0,05 para a altura dos potes de pólen a 95.136,43kg para o peso; e para as variâncias residuais, os valores encontrados variaram de 0,02 para a variável largura dos potes de mel a 56.548,71kg para o peso. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,35 a 0,53. Os resultados demonstraram que as características avaliadas possuem variação genética aditiva que garante boa resposta à seleção.

The aim of this study was to estimate components of genetic variance, phenotypic and residual and heritability for traits related to the production of honey and the nest structure of bee Melipona quadrifasciata anthidioides. Sixty colonies from different regions of Bahia were transferred to standard INPA model boxes and divided, creating the parental generations G1 and G2. The following characteristics were measured: estimated production of honey, number, width, height and volume of the honey pots, number, height and diameter of pollen storage pots, weight, number, length and diameter of the brood combs and estimate the population of the colony. The measurements were corrected for the fixed effects of month of measurement. The variance components and heritability were estimated by the method of similarity between relatives using the Bayesian approach. The mean and standard deviations ranged from 2.01±0.70cm diameter pots for pollen to 2333.0±384.1kg to the weight of the boxes. There was indication of convergence for all the chains obtained. Estimates of the additive genetic variance ranged from 0.02cm to the width characteristics of honey pots to 38587.72kg for weight. For the estimates of phenotypic variance the values ranged from 0.05 for the height of the pollen pots to 95136.43kg for weight; and the residual variance the values varied from 0.02 for the variable width of the honey pots to 56548.71kg for weight. The results showed that the characteristics assessed have additive genetic variation that ensures good response to selection.

Utilização de modelos unicaracterística e multicaracterística na estimação de parâmetros genéticos na raça Nelore / Utilization of single-trait and multi-trait models applied to genetic parameter estimation in Nellore Cattle

Estimativas dos parâmetros genéticos e dos componentes de covariância para peso ao nascimento (PN), peso à desmama (PD), circunferência escrotal (CE), ganho de peso pós-desmama (GP) e musculosidade (MUSC) foram obtidas com modelos unicaracterística, bicaracterística e multicaracterística, utilizando-se um banco de dados de 69.525 animais da raça Nelore. Os parâmetros foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, com modelos que incluíram o efeito genético aditivo direto e materno, além do grupo de manejo a desmama e de ambiente permanente da vaca, todos como aleatórios, e do efeito fixo de grupo de contemporâneo. Os coeficientes de herdabilidade estimados para as características pós-desmama com o modelo multicaracterística (0,45; 0,31 e 0,25, respectivamente, para CE, GP e MUSC) foram maiores que as estimativas obtidas com os modelos unicaracterística (0,42; 0,21 e 0,22) e bicaracterística (0,39; 0,25 e 0,24). Da mesma forma, as correlações genéticas estimadas foram, em grande parte, maiores para o modelo multicaracterística. Estes resultados indicam que a redução do viés, proporcionada pelo modelo multicaracterística, aumenta as estimativas dos parâmetros genéticos e demonstra que os resultados com análises unicaracterística e bicaracterística são subestimados. Os resultados da resposta à seleção demonstraram que a musculosidade apresentou grande potencial seletivo, e o cálculo das respostas correlacionadas de musculosidade e demais características estudadas demonstrou que sua utilização em programas de seleção pode ser vantajosa aos criadores...

Genetic parameters and components of (co)variance for birth weight (BW), weaning weight (WW), scrotal circumference (SC), weight gain at post-weaning (WG), and muscle score (MUSC) were obtained with univariate, bivariate and multivariate models, using a dataset of 69,525 Nellore cattle. The parameters were estimated by restricted maximum likelihood method. Direct and maternal additive genetic effects, group of management, and maternal permanent environmental effect were adjusted as random effects, while contemporary group was adjusted as fixed effect. Multivariate approach allowed higher estimate heritability for postweaning traits (0.45; 0.31 and 0.25, respectively for SC, WG and MUSC) than univariate (0,42; 0,21 and 0,22) and bivariate models (0,39; 0,25 and 0,24). Similarly, the genetic correlations were higher in the multivariate approach. These results indicate that reducing the bias provided by the mutivariate model improves the estimates of genetic parameters and shows that the results of bivariate and univarite models are underestimated. Selection for muscle score presented great potential for correlated response in other traits and its use in selection programs can be a useful tool for breeders...

Variabilidade genética do peso ao nascer e seleção para crescimento em bubalinos do Estado do Pará, Brasil / Genetic variability of birth weight and selection for growth of water buffaloes from State of Pará, Brazil

Birth weight is a performance parameter of great zootechnical importance for both meat and dairy production, as well as for breeding animals, mainly due to its relation to survival rate at weaning, and the weight of animals throughout their developmental and growth phases. Therefore, the objective of this work was to establish heritability estimates, as well as phenotypic and genetic trends of birth weight of water buffaloes from State of Pará, Brazil. Descriptive statistics were calculated and the Shapiro-Wilk Normality test was performed with a Statistical Analysis System package. Heritability estimates were established by Bayesian inference. BW was 36.6 kg in average. The statistical model considered sex, year of birth and breed composition of the animals as fixed effects, and animal, maternal and residual as random effects. Direct heritability was platykurtic (flattened) and with higher asymmetry, presenting a bimodal distribution with the first mode close to 0.10, and the second mode close to 0.30; the maternal heritability was trimodal, with peaks very close to 0.15, and another, less evident, close to 0.20. The direct genetic trend of birth weight was negative (-0.03kg year-1) and maternal genetic trend was close to zero (0.001kg ano-1), even though the phenotypic trend had been positive (0.156 kg year-1). There is genetic variability to be addressed in a breeding program, however, very little was done as far as selection for growth of water buffaloes in the State of Pará.

O peso ao nascer constitui característica produtiva de elevada importância zootécnica, devido à sua relação com a taxa de sobrevivência à desmama e com os pesos nas demais fases de desenvolvimento do animal, quer seja para a produção de carne, leite ou em animais que se destinam à reprodução. O objetivo deste trabalho foi obter estimativas de herdabilidade e tendências fenotípicas e genéticas do peso ao nascer, em bubalinos do Estado do Pará, Brasil. Foram calculadas as estatísticas descritivas e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade foram obtidas por inferência Bayesiana. O peso ao nascer apresentou média de 36,6 kg. O modelo de análise considerou como fixos os efeitos de sexo, ano de nascimento e composição racial do animal e como efeitos aleatórios animal, efeito materno e residual. A distribuição da herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica (achatada) e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos a 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética direta do peso ao nascer mostrou-se negativa (-0,03kg ano-1) e a tendência genética materna próxima à zero (0,001 kg ano-1), ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg ano-1). Existe variabilidade genética possível de ser trabalhada em um programa de melhoramento, no entanto, pouco foi feito quanto à seleção para crescimento em búfalos no Estado do Pará.

Carcinogenesis Colorrectal. Nuevas perspectivas e implicancias clínicas para su detección / Colorectal Carcinogenesis. New perspectives and clinical implications for its detection

El cáncer colorrectal (CCR) es una de las principales causas de morbilidad y mortalidad a nivel mundial. Clásicamente se considera a los adenomas como las lesiones precursoras del CCR y se estipula un tiempo de 10 a 15 años para completar la secuencia adenoma-carcinoma. El CCR evoluciona a través de la acumulación progresiva de alteraciones genéticas y epigenéticas, las que conducen a la transformación de la mucosa colónica normal en cáncer invasivo. La identificación de diferentes vías moleculares de carcinogénesis colorrectal ha demostrado la naturaleza heterogénea del cáncer colónico. De reciente descripción, las lesiones aserradas muestran cambios moleculares y patológicos distintos a los adenomas tradicionales, estimándose que presentan un tiempo más acelerado de evolución hacia la malignidad. El objetivo de esta revisión es actualizar conocimientos sobre la génesis tumoral y sus bases biomoleculares a fin de posibilitar su aplicación a etapas clínicas concretas como la prevención y el tratamiento

Colorectal cancer (CRC) is one of the main causes of morbidity and mortality worldwide. Adenomas are classically regarded as precursor lesions of CRC and between 10 and 15 years is thought to elapse to complete the adenoma-carcinoma sequence. CRC evolves through the progressive accumulation of genetic and epigenetic alterations that lead to invasive cancer through the transformation of normal colonic mucosa. The identification of different molecular pathways of colorectal carcinogenesis has demonstrated the heterogeneous nature of colon cancer. Recent description of serrated lesions shows molecular and pathological changes other than traditional adenomas with an estimated faster time of progression to malignancy. The aim of this review is to update the knowledge about tumorigenesis and its biomolecular basis for clinical application in early stages providing firm ground for prevention and treatment

Estudo de mutações pontuais de BRCA1, BRCA2, CHEK2 e TP53 em pacientes com alto risco para câncer de mama e ovário hereditário / Study of point mutations of BRCA1, BRCA2, CHEK2, and TP53 in patients at high risk for hereditary breast and ovarian cancer

INTRODUÇÃO: BRCA1, BRCA2, CHEK2 e TP53 são os principais genes supressores tumorais associados às síndromes de câncer de mama e ovário hereditário (HBOC) e Li-Fraumeni (LFS/LFL). Em cânceres hereditários, a frequência de mutações em genes de baixa penetrância, como CHEK2, está entre 1-10%, entretanto nos genes de alta penetrância, como BRCA1/2 e TP53, a frequência é <1%. Até o momento, estudos feitos no Brasil apenas descreveram apenas o perfil de susceptibilidade genética de populações das regiões sul/sudeste. OBJETIVO: Analisar a ancestralidade e oito mutações dos genes BRCA1, BRCA2, CHEK2 e TP53 em 102 pacientes com alto risco para HBOC do Nordeste do Brasil...

INTRODUCTION: BRCA1, BRCA2, CHEK2 and TP53 are the mainly tumor suppressor genes associated with Hereditary Breast and Ovarian Cancer (HBOC) and Li-Fraumeni (LFS/LFL) syndromes. In hereditary cancers the frequency of mutations in susceptibility genes of low penetrance like CHEK2 is 1-10%, while in genes of high penetrance as BRCA1/2 and TP53 is <1%. Until now, the studies done in Brazil only described the susceptibility profile of populations from the south/southeast regions. OBJECTIVE: To analyze the ancestry and eight mutations of BRCA1, BRCA2, CHEK2 and TP53 genes in 102 patients at high-risk for HBOC from the Northeast of Brazil...